교양교육센터는 책임교수위원회와 기획연구부로 구성되어 있다. 책임교수위원회는 교육혁신본부장(위원장, 당연직)·교무부처장(당연직)·교양 각 영역별 책임교수 7명이 교양 교육과정과 관련된 전반적인 사항의 1차 심의를 담당하고 있다. 기획연구부는 교양 교육과정에 관한 기획, 평가, 프로그램 개발 및 운영, 연구 등의 실질적 업무를 수행하고 있다.
